19 세기 말, 정교회 인구의 수의 증가는 새로운 정교회 성당의 건설을 필요로. 축일 교회의시에 존재하는 신자의 증가에 대한 작은되었고, 또한 그것의 위치는 매우 편안하지 않았다. 1885 년 에스토니아의 주지사로 임명되었다 왕자 세르게이 Shakhovskoy는 정교회의 건설을 시작하고이 아이디어의 실현을위한 기금을 마련 할 수있는 권한을 받았다. 기부는 모든 러시아 각지에서 여기에 건설 받았다. 결과적으로 9 월 15 일 1899 사원 건설 충분한 자금을 수집 하였다.

성당 1888년 10월 17일에서 발생한 끔찍한 열차 충돌시 차르 알렉산더 III와 그의 가족의 특별한 구조 후, 성령 프린스 알렉산더 넵 스키 헌신하기로 결정했다. 아주 조심스럽게 미래 교회의 건축을위한 장소를 선택했다. 여덟 제안 옵션 Vyshgorod에서 총독의 궁전 앞에 멈춰 섰다. 1893년 8월, 성당의 미래를위한 장소의 헌신의 엄숙한 의식에서. 행사에 그것은 Pühtitsa 수도원에서 전달 하나님의 어머니의 Dormition의 기적 아이콘, 주어졌다.

이 프로젝트는 미하일 칼라 쉬니 코프 축일, 교회 건물에 대한 전문가, 예술의 상트 페테르부르크 아카데미의 회원의 성당 건축의 학회 회원을 생산 .  처음에,이 프로젝트는 대리석 iconostasis의 설치를 포함하지만, 건설 중에 나무 도금에 교체하기로 결정했다 .  아이콘은 스튜디오 그림 학회 회원 알렉산더 Nikanorovich Novoskoltseva에 기록 된 .  상트 페테르부르크 마스터 에밀 Karlovich Shteinke 메인 제단 예배당의 창문에 설치된 스테인드 글라스 창문은 그의 스케치 제작에 따르면 .  벨 종탑 공장 상인 바실리 Mikhailovich 올 로브 세인트 피터스 버그에서 생산 .  성당의 종소리의 울림은 11 .  벨은 서로 다른 이미지와 비문 캐스팅 .  그 결과 17 세기 모스크바 교회의 모델을 만들어 사원 trehprestoly의 건설이었다, 약 1,500 명을 수용 할 수 있습니다 .  아키텍처의 학회 회원에 의해 모자이크로 장식 된 성당의 외관 . H . 프롤로 . 

알렉산드르 넵 스키의 이름에 성당의 헌신의 의식은 그분의 은혜, 리가와 Mitava의 주교 Agafangel 하였다 1900년 4월 30일를 개최했다. 행사는 성이 참석했다 권리. 약. 크론 슈타 트의 존.

20 대 초반에, 그것은뿐만 사원 철거하기로 결정했다 "러시아 폭력에 기념비를." 에스토니아도이 결정의 이행을위한 자금을 수집하기 시작했다. 1928 년 말 법안은 세인트 알렉산드르 넵 스키 성당을 철거하기 위해 도입되었다. 사원은 세계 정교회 지역 사회의 힘을 방어 할 수 있었다. 차 세계 대전 동안, 성당 폐쇄, 그리고 다시 그 파괴의 문제를 제기했다.

60 년 동안이 성당은 천문관에서 변환 할 수있다. 재건에서 사원 알렉산더 넵 스키는 젊은 탈린의 주교와 에스토니아 알렉세이, 모스크바의 미래 대주교와 모든 러시아 알렉세이 II 냈습니다. 1999 년, 특별한 보호 탈린 알렉산드르 넵 스키 성당의 표시로 교회, 모스크바와 모든 러시아의 총 대주교의 직접적인 종속을 의미 상태 Stavropegic을 받았다. 행동과 성당 요즘 8~9시간 열려 매일.